Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms