Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms