Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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