Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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