Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Thsd1Q9JM61 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Thsd1Q9JM61 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Thsd1Q9JM61 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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