Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms