Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlr5Q9JLF7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms