Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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