Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms