Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Zfhx4Q9JJN2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Zfhx4Q9JJN2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Zfhx4Q9JJN2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfhx4Q9JJN2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms