Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1cc1Q9ESK9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms