Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc4Q9ES56 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms