Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clstn1Q9EPL2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms