Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rarres2Q9DD06 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms