Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn3Q9DCB1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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