Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne8Q9DC53 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms