Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc97Q9DBT3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc97Q9DBT3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc97Q9DBT3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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