Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms