Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms