Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cnpy3Q9DAU1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cnpy3Q9DAU1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnpy3Q9DAU1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms