Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms