Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem239Q9DA47 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tmem239Q9DA47 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Tmem239Q9DA47 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Tmem239Q9DA47 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Tmem239Q9DA47 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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