Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf138rt1Q9D9M9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms