Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmco5aQ9D9D5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms