Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Alkbh4Q9D8F1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Alkbh4Q9D8F1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms