Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms