Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rep15Q9D7T1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rep15Q9D7T1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rep15Q9D7T1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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