Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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