Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms