Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3a3Q9D554 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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