Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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