Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms