Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D454 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D454 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D454 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D454 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9D454 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms