Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms