Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D2Q3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D2Q3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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