Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chordc1Q9D1P4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms