Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc167Q9D162 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms