Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms