Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms