Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mms19Q9D071 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mms19Q9D071 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mms19Q9D071 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mms19Q9D071 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mms19Q9D071 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mms19Q9D071 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mms19Q9D071 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mms19Q9D071 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mms19Q9D071 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mms19Q9D071 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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