Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snf8Q9CZ28 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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