Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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