Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Utp23Q9CX11 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Utp23Q9CX11 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Utp23Q9CX11 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Utp23Q9CX11 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Utp23Q9CX11 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp23Q9CX11 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms