Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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