Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pin4Q9CWW6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms