Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdca4Q9CWM2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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