Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms