Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sycp2Q9CUU3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms