Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sppl3Q9CUS9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms