Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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